Главной целью Академии является всестороннее развитие, воспитание футболистов, достойных выступать в главной команде клуба, а также образованных и уважающих традиции своего клуба. Важным направлением работы является налаживание взаимопонимания, общей поведенческой стратегии, где родители и тренеры действуют сообща и главной целью ставят развитие юного футболиста.
Академия «Крыльев Советов» работает над подготовкой высококлассных футболистов, воспитанием цельных и гармоничных личностей. Футбольные достижения являются вершиной пирамиды, в основании которой лежат личностное развитие, образованность, самодисциплина и психологическая подготовленность.
Базовыми ценностями для воспитанников Академии «Крыльев Советов» являются уважение к традициям, истории и ветеранам клуба, самоотдача в матче и на тренировке, дисциплина на футбольном поле и за его пределами, достоинство в поражениях и победах, уважение к партнерам и болельщикам.